El Rector, de acuerdo al artículo 33° de la Ley Universitaria y el artículo 173° del Estatuto de la UNSAAC, es el personero y representante legal de la Universidad.

Sus atribuciones son:

• Presidir las sesiones de la Asamblea Universitaria
• Así como del Consejo Universitario
• Hacer cumplir sus acuerdos

Es el conductor de la vida académica, administrativa, económica y financiera de la Institución.

La elección del Rector es por un período de 5 años.